Узбекистан, Ташкент – Podrobno.uz. Ученые Центра геномики и биоинформатики Академии наук Республики Узбекистан впервые полностью секвенировали геномы коронавируса в стране и провели их биоинформатический анализ. Полученные результаты были загружены в международную открытую базу данных вирусных геномов GISAID.
Благодаря этому исследованию Узбекистан вошел в число 50 государств мира, полностью расшифровавших ДНК-последовательности всех вариантов коронавируса на своей территории. Специалисты центра отобрали образцы у 62 граждан с подтвержденным диагнозом в Управлении санитарно-эпидемиологического благополучия и общественного здоровья Ташкентской области и частной клинике Biogen Med. При помощи секвенатора нового поколения были полностью проанализированы 32 образца, что соответствует длине цепочки в 29 903 нуклеотида.
Биоинформатический анализ с использованием программы Nextclade позволил сравнить циркулирующие в республике варианты с глобальной базой данных и определить положение 18 образцов на филогенетическом древе. Выяснилось, что выявленные штаммы относятся к группам GR (20V) и S (19V). Группа GR (20V) на древе соседствует с вирусами из стран Европы, Азии, Африки и Австралии, тогда как группа S (19V) объединяет геномы, характерные для азиатского и африканского регионов, что указывает на множественные источники заноса инфекции.
Полная расшифровка геномов COVID-19 и их сравнительный анализ с мировыми базами данных создали основу для постоянного мониторинга мутаций вируса в местных условиях. Полученные данные имеют критическое значение для разработки отечественной вакцины, ориентированной на борьбу со специфическими штаммами, циркулирующими в Узбекистане.
Комментарии отсутствуют